Surveiller la progression de l’analyse
1 Surveillez la progression, les intensités et les scores de qualité de l’analyse à mesure que les indicateurs s’affichent à l’écran.
Figure 23 Progression et indicateurs de l’analyse de séquençage
A Progression de l’analyse : indique l’étape en cours et le nombre de cycles réalisés pour chaque lecture. La barre de progression n’est pas proportionnelle à la durée d’analyse de chaque étape.
B Q-Score (Notation de la qualité) : indique la répartition des scores de qualité (Q-scores).
Consultez
Notation de la qualité à la page 72
.
C Intensity (Intensité) : indique la valeur de l’intensité des amplifiats du 90 e centile de chaque plaque. Les couleurs du tracé indiquent chaque base : A est rouge, C vert, G bleu et T noir.
D Cluster Density (Densité des amplifiats) (K/mm²) : indique le nombre dʼamplifiats détectés pour lʼanalyse.
E Clusters Passing Filter (Amplifiats passant le filtre) (%) : indique le pourcentage d’amplifiats passant le filtre. Consultez
Amplifiats passant le filtre à la page 72 .
F Estimated Yield (Estimation du rendement) (Gb) : indique le nombre de bases prévues pour l’analyse.
G État du transfert de données : indique l’état du transfert de données en fonction de la configuration de l’analyse.
H Fin de l’analyse : indique la date et l’heure de fin de l’analyse (au format aaaa-mm-jj et hh:mm).
REMARQUE
Après avoir sélectionné Home (Accueil), il est impossible de revenir en arrière pour afficher les indicateurs de l’analyse. Toutefois, vous pouvez les consulter dans BaseSpace ou bien dans le Visualiseur d’analyse de séquençage ou dans Local Run Manager sur un ordinateur du réseau.
Cycles des indicateurs de l’analyse
Les indicateurs d’analyse apparaissent à différents moments au cours d’une analyse.
}
Aucun indicateur ne s’affiche au cours des étapes de génération d’amplifiats.
}
Les cinq premiers cycles sont réservés à la génération du modèle.
} Au sixième cycle, la densité brute des amplifiats et les intensités du premier cycle s’affichent.
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Support nº 20002370
Document nº 1000000002695 v00 FRA
}
Au vingt-cinquième cycle, la proportion d’amplifiats passant le filtre, le rendement et les scores de qualité s’affichent.
Sequencing Analysis Viewer
Le logiciel Sequencing Analysis Viewer affiche des indicateurs de séquençage générés au cours de l’analyse de séquençage. Les indicateurs s’affichent sous forme de diagrammes, de graphiques et de tableaux qui s’appuient sur des données générées par le RTA et écrits sur des fichiers InterOp. Les indicateurs sont mis à jour pendant la progression de l’analyse.
Sélectionnez Refresh (Rafraîchir) à tout moment au cours de l’analyse pour afficher les indicateurs mis à jour. Pour plus de renseignements, consultez le Guide de l’utilisateur de
Sequencing Analysis Viewer (référence 15020619).
Le Sequencing Analysis Viewer est compris dans le logiciel installé sur l’ordinateur de l’instrument. Vous pouvez aussi installer le Sequencing Analysis Viewer sur un autre ordinateur associé au même réseau que l’instrument pour surveiller les indicateurs d’analyse à distance.
État du transfert de données
En fonction de la configuration d’analyse sélectionnée, une icône s’affiche à l’écran au cours de l’analyse pour indiquer l’état de connexion.
État
BaseSpace
BaseSpace Onsite Local
Run
Manager
Autonome
Connecté
Transfert de données en cours
Déconnecté
Désactivé
Il se peut que plusieurs icônes apparaissent à l’écran. Par exemple, si des données d’analyse sont en cours de transfert dans BaseSpace et dans un dossier de sortie supplémentaire, une icône BaseSpace et une icône Autonome apparaissent.
Service de copie de l’analyse
La suite logicielle du système MiniSeq contient un service de copie de l’analyse. Pendant que RTA génère des fichiers, le service copie les fichiers dans l’emplacement spécifié du dossier de sortie.
Si le transfert de données est interrompu en cours d’analyse, les données sont stockées temporairement sur l’ordinateur de l’instrument. Lorsque la connexion est rétablie, le transfert des données reprend automatiquement durant l’analyse. Si la connexion ne se rétablit pas avant la fin de l’analyse, déplacez manuellement les données vers l’emplacement choisi.
Guide du système MiniSeq
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Transfert des données dans BaseSpace
BaseSpace Broker transfère les données de l’analyse dans BaseSpace. Si la connexion à
BaseSpace est interrompue, le broker tente à nouveau de charger les données durant sept jours. Si la connexion n’a pas été rétablie au bout de sept jours, les données de l’analyse sont effacées.
Si vous indiquez un emplacement supplémentaire pour les données de l’analyse, les données sont transférées à cet emplacement, quel que soit l’état de BaseSpace Broker.
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Support nº 20002370
Document nº 1000000002695 v00 FRA
